1647年年初，李自成死后的一年半以后，肆虐中华大地的另一个大佬张献忠死于清军的一次突袭。有一点不得不说，张献忠和李自成都是意外死亡，以后自己的主力都还尚在。李自成死时，他的两路大顺军还有35万之众;而张献忠也不例外，张献忠中箭身亡时，他的大西军也还有20万以上。那么它的这些大西军又去哪了呢？
一、大西军在云南站稳了脚跟
张献忠死了以后，他和那位李自成一样也是没有确立继承人，这就造成了他手下的孙可望、李定国、刘文秀等人的矛盾。不过当时大量的清军就在身后，他们没有精力内斗，只能先摆脱清军再想办法。大西军从四川进入贵州，打算以贵州为基地东山再起。但是云南沙定洲叛乱的消息传来以后，这几个有些战略眼光的将领明白机会来了。当时云南虽然还在南明的控制之下，但是基础十分薄弱。沙定洲叛乱以后，黔国公沐天波只能坚守楚雄，根本无力反击。大西军在1647年2月开始向云南进军，沙定洲的叛乱都是一些土司的军队所为，大西军三下五除二就平定了叛乱，成功进入了昆明。
占领了云南地区之后，孙可望、李定国等人和明朝在云南的势力象征沐天波达成了一致意见：第一不再使用大西年号‘第二不准随意杀人;第三不准奸淫妇女。在双方的共同努力下，其他周边的省份打的是难解难分，而云南地区的百姓生活还是比较安宁的。当时农民军（大西军）在云南并没有白吃白喝，他们开始开荒种地，解决基本的粮食供应问题。也算是老天帮忙，农民军占领云南的三年里年年都是丰收，这种情况在明末是不多见到的。在军纪上，农民军相比之前强太多了。一名士兵误伤了一个小孩，结果这名士兵被斩首，首级挂于西门。
二、云南成为永历朝的大本营
就在农民军在云南过太平日子的时候，南明的情况岌岌可危。当时永历政权所能控制的区域已经仅剩下广西西部和贵州一带，在这样的局面下，孙可望请求永历皇帝等人进入云南，但条件是加封其为秦王。起初永历朝廷并没有同意，最后孙可望以自己出兵抗清为诱饵，南明方面最终同意的册封。当时南宁也已经失守，永历朝所能控制的区域已经所剩无几，最后不得不选择进入云南。当时永历皇帝身边的文武官员已经不过了，换句话说，永历皇帝已经把这个王朝的命运交给了昔日的对手农民军。
1651年，李定国统帅骑兵1万、步兵8万开始向湖南发动进攻。当时清军的主力一部分已经回撤，另一部分在武昌一带，李定国进军迅速，快速占领了湖南南部。从而切断了南宁地区孔有德和两湖地区清军的联系，清算这个败类的时候到了。这年7月，李定国南下包围了桂林，那位大清的定南王孔有德就在城中。四天以后，李定国的军队攻入城内，孔有德自知自己难逃一死，在王府中自杀而亡。李定国在湖南、广西节节胜利的消息传到了北京，北京的顺治皇帝恐慌不已，他立刻命令敬谨亲王尼堪率领八旗精锐南下。只可惜这位满清的亲王走进了李定国的埋伏圈，最后尼堪被明军斩首。尼堪成为明朝在战场上斩杀的唯一满洲亲王，诗人彭而述闻讯后激动的写道：东珠璀璨嵌兜鍪，千金竟购大王头。